Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYP4

Tmem88b, Transmembrane protein 88B, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88bQ3TYP4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem88bQ3TYP4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem88bQ3TYP4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms