Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gtf3c3Q3TMP1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Gtf3c3Q3TMP1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms