Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Smarca4Q3TKT4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Smarca4Q3TKT4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Smarca4Q3TKT4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Smarca4Q3TKT4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Smarca4Q3TKT4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Smarca4Q3TKT4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Smarca4Q3TKT4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Smarca4Q3TKT4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Smarca4Q3TKT4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Smarca4Q3TKT4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Smarca4Q3TKT4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Smarca4Q3TKT4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Smarca4Q3TKT4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Smarca4Q3TKT4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Smarca4Q3TKT4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Smarca4Q3TKT4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Smarca4Q3TKT4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
Smarca4Q3TKT4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Smarca4Q3TKT4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Smarca4Q3TKT4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Smarca4Q3TKT4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Smarca4Q3TKT4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Smarca4Q3TKT4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Smarca4Q3TKT4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Smarca4Q3TKT4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Smarca4Q3TKT4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Smarca4Q3TKT4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Smarca4Q3TKT4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Smarca4Q3TKT4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Smarca4Q3TKT4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Smarca4Q3TKT4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Smarca4Q3TKT4 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Smarca4Q3TKT4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Smarca4Q3TKT4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Smarca4Q3TKT4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Smarca4Q3TKT4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Smarca4Q3TKT4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Smarca4Q3TKT4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Smarca4Q3TKT4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Smarca4Q3TKT4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Smarca4Q3TKT4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Smarca4Q3TKT4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Smarca4Q3TKT4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Smarca4Q3TKT4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Smarca4Q3TKT4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Smarca4Q3TKT4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Smarca4Q3TKT4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Smarca4Q3TKT4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Smarca4Q3TKT4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Smarca4Q3TKT4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Smarca4Q3TKT4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Smarca4Q3TKT4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Smarca4Q3TKT4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Smarca4Q3TKT4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
Smarca4Q3TKT4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Smarca4Q3TKT4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Smarca4Q3TKT4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Smarca4Q3TKT4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Smarca4Q3TKT4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Smarca4Q3TKT4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Smarca4Q3TKT4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Smarca4Q3TKT4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Smarca4Q3TKT4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Smarca4Q3TKT4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Smarca4Q3TKT4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Smarca4Q3TKT4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Smarca4Q3TKT4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Smarca4Q3TKT4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Smarca4Q3TKT4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Smarca4Q3TKT4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Smarca4Q3TKT4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Smarca4Q3TKT4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Smarca4Q3TKT4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Smarca4Q3TKT4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Smarca4Q3TKT4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Smarca4Q3TKT4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Smarca4Q3TKT4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Smarca4Q3TKT4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Smarca4Q3TKT4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Smarca4Q3TKT4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Smarca4Q3TKT4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Smarca4Q3TKT4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Smarca4Q3TKT4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Smarca4Q3TKT4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Smarca4Q3TKT4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Smarca4Q3TKT4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Smarca4Q3TKT4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Smarca4Q3TKT4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Smarca4Q3TKT4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Smarca4Q3TKT4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Smarca4Q3TKT4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Smarca4Q3TKT4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Smarca4Q3TKT4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
Smarca4Q3TKT4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Smarca4Q3TKT4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Smarca4Q3TKT4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Smarca4Q3TKT4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Smarca4Q3TKT4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Smarca4Q3TKT4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms