Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RubcnlQ3TD16 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RubcnlQ3TD16 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms