Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNL4

UPF0728 protein C10orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3KNL4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q3KNL4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q3KNL4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3KNL4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3KNL4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3KNL4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3KNL4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3KNL4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3KNL4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3KNL4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3KNL4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms