Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
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Shroom4Q1W617 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Shroom4Q1W617 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
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Shroom4Q1W617 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
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Shroom4Q1W617 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
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Shroom4Q1W617 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Shroom4Q1W617 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Shroom4Q1W617 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Shroom4Q1W617 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
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Shroom4Q1W617 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Shroom4Q1W617 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Shroom4Q1W617 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Shroom4Q1W617 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Shroom4Q1W617 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Shroom4Q1W617 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Shroom4Q1W617 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Shroom4Q1W617 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Shroom4Q1W617 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Shroom4Q1W617 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Shroom4Q1W617 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Shroom4Q1W617 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Shroom4Q1W617 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Shroom4Q1W617 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Shroom4Q1W617 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Shroom4Q1W617 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Shroom4Q1W617 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Shroom4Q1W617 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms