Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ptchd1Q14B62 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
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ptchd1Q14B62 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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ptchd1Q14B62 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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ptchd1Q14B62 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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ptchd1Q14B62 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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ptchd1Q14B62 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
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ptchd1Q14B62 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ptchd1Q14B62 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ptchd1Q14B62 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ptchd1Q14B62 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ptchd1Q14B62 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ptchd1Q14B62 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ptchd1Q14B62 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ptchd1Q14B62 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ptchd1Q14B62 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ptchd1Q14B62 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ptchd1Q14B62 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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