Protein–RNA interactions for Protein: Q0VET5

Lmntd2, Lamin tail domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd2Q0VET5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmntd2Q0VET5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmntd2Q0VET5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmntd2Q0VET5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmntd2Q0VET5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmntd2Q0VET5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmntd2Q0VET5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmntd2Q0VET5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lmntd2Q0VET5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmntd2Q0VET5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmntd2Q0VET5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmntd2Q0VET5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmntd2Q0VET5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmntd2Q0VET5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lmntd2Q0VET5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lmntd2Q0VET5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lmntd2Q0VET5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Lmntd2Q0VET5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lmntd2Q0VET5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Lmntd2Q0VET5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmntd2Q0VET5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmntd2Q0VET5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Lmntd2Q0VET5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms