Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TrioQ0KL02 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TrioQ0KL02 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms