Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Znf541Q0GGX2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Znf541Q0GGX2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Znf541Q0GGX2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Znf541Q0GGX2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Znf541Q0GGX2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Znf541Q0GGX2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Znf541Q0GGX2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Znf541Q0GGX2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Znf541Q0GGX2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Znf541Q0GGX2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Znf541Q0GGX2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Znf541Q0GGX2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Znf541Q0GGX2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Znf541Q0GGX2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Znf541Q0GGX2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Znf541Q0GGX2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Znf541Q0GGX2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Znf541Q0GGX2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Znf541Q0GGX2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Znf541Q0GGX2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Znf541Q0GGX2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Znf541Q0GGX2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Znf541Q0GGX2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Znf541Q0GGX2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Znf541Q0GGX2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Znf541Q0GGX2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Znf541Q0GGX2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Znf541Q0GGX2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Znf541Q0GGX2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Znf541Q0GGX2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Znf541Q0GGX2 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Znf541Q0GGX2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Znf541Q0GGX2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms