Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sh3bp2Q06649 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sh3bp2Q06649 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Sh3bp2Q06649 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms