Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Cab39Q06138 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cab39Q06138 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms