Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ddr1Q03146 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ddr1Q03146 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms