Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Epha4Q03137 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Epha4Q03137 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms