Protein–RNA interactions for Protein: Q02956

Prkcz, Protein kinase C zeta type, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkczQ02956 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PrkczQ02956 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PrkczQ02956 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PrkczQ02956 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms