Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Sec23aQ01405 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Sec23aQ01405 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Sec23aQ01405 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms