Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Top2aQ01320 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Top2aQ01320 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Top2aQ01320 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Top2aQ01320 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Top2aQ01320 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Top2aQ01320 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Top2aQ01320 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Top2aQ01320 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Top2aQ01320 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Top2aQ01320 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Top2aQ01320 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Top2aQ01320 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Top2aQ01320 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Top2aQ01320 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Top2aQ01320 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Top2aQ01320 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Top2aQ01320 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Top2aQ01320 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Top2aQ01320 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Top2aQ01320 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Top2aQ01320 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Top2aQ01320 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Top2aQ01320 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Top2aQ01320 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Top2aQ01320 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Top2aQ01320 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Top2aQ01320 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Top2aQ01320 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Top2aQ01320 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Top2aQ01320 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Top2aQ01320 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Top2aQ01320 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Top2aQ01320 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Top2aQ01320 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Top2aQ01320 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Top2aQ01320 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Top2aQ01320 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms