Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Grin2cQ01098 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Grin2cQ01098 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms