Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lama4P97927 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lama4P97927 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Lama4P97927 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lama4P97927 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lama4P97927 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lama4P97927 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lama4P97927 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lama4P97927 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lama4P97927 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lama4P97927 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lama4P97927 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms