Protein–RNA interactions for Protein: P97412

Lyst, Lysosomal-trafficking regulator, mousemouse

Predictions only

Length 3,788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LystP97412 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LystP97412 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LystP97412 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LystP97412 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LystP97412 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LystP97412 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LystP97412 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LystP97412 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LystP97412 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LystP97412 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LystP97412 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LystP97412 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LystP97412 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LystP97412 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LystP97412 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LystP97412 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LystP97412 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LystP97412 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LystP97412 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LystP97412 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LystP97412 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LystP97412 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LystP97412 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LystP97412 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LystP97412 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LystP97412 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LystP97412 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LystP97412 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LystP97412 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LystP97412 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LystP97412 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LystP97412 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LystP97412 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LystP97412 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LystP97412 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LystP97412 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LystP97412 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LystP97412 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LystP97412 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LystP97412 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LystP97412 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LystP97412 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LystP97412 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LystP97412 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LystP97412 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LystP97412 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LystP97412 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LystP97412 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LystP97412 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LystP97412 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LystP97412 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LystP97412 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LystP97412 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LystP97412 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LystP97412 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LystP97412 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LystP97412 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LystP97412 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LystP97412 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LystP97412 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LystP97412 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LystP97412 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LystP97412 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LystP97412 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LystP97412 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LystP97412 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LystP97412 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LystP97412 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LystP97412 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LystP97412 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LystP97412 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LystP97412 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LystP97412 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LystP97412 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LystP97412 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LystP97412 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LystP97412 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LystP97412 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LystP97412 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LystP97412 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LystP97412 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LystP97412 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LystP97412 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LystP97412 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LystP97412 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LystP97412 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LystP97412 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LystP97412 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LystP97412 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LystP97412 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LystP97412 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LystP97412 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LystP97412 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LystP97412 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LystP97412 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LystP97412 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LystP97412 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LystP97412 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LystP97412 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LystP97412 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms