Protein–RNA interactions for Protein: P81270

Erg, Transcriptional regulator ERG, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErgP81270 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ErgP81270 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ErgP81270 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ErgP81270 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ErgP81270 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ErgP81270 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ErgP81270 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ErgP81270 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ErgP81270 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ErgP81270 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ErgP81270 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ErgP81270 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ErgP81270 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ErgP81270 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ErgP81270 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ErgP81270 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ErgP81270 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ErgP81270 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ErgP81270 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ErgP81270 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ErgP81270 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ErgP81270 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ErgP81270 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ErgP81270 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ErgP81270 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ErgP81270 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ErgP81270 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ErgP81270 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ErgP81270 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ErgP81270 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ErgP81270 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ErgP81270 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ErgP81270 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ErgP81270 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ErgP81270 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ErgP81270 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ErgP81270 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ErgP81270 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ErgP81270 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ErgP81270 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ErgP81270 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ErgP81270 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ErgP81270 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ErgP81270 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ErgP81270 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ErgP81270 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ErgP81270 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ErgP81270 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ErgP81270 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ErgP81270 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ErgP81270 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ErgP81270 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ErgP81270 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ErgP81270 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ErgP81270 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ErgP81270 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ErgP81270 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ErgP81270 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ErgP81270 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ErgP81270 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ErgP81270 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ErgP81270 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ErgP81270 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ErgP81270 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ErgP81270 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ErgP81270 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ErgP81270 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ErgP81270 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ErgP81270 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ErgP81270 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ErgP81270 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ErgP81270 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ErgP81270 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ErgP81270 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ErgP81270 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ErgP81270 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ErgP81270 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ErgP81270 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ErgP81270 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ErgP81270 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ErgP81270 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ErgP81270 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ErgP81270 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ErgP81270 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ErgP81270 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ErgP81270 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ErgP81270 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ErgP81270 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ErgP81270 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ErgP81270 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ErgP81270 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ErgP81270 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ErgP81270 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ErgP81270 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ErgP81270 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ErgP81270 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ErgP81270 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ErgP81270 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ErgP81270 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ErgP81270 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms