Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otx2P80206 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otx2P80206 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Otx2P80206 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otx2P80206 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otx2P80206 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otx2P80206 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Otx2P80206 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Otx2P80206 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Otx2P80206 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Otx2P80206 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms