Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Polr1bP70700 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Polr1bP70700 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms