Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tgif1P70284 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Tgif1P70284 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms