Protein–RNA interactions for Protein: P63157

Barhl1, BarH-like 1 homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barhl1P63157 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Barhl1P63157 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Barhl1P63157 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms