Protein–RNA interactions for Protein: P63072

Ubd, Ubiquitin D, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbdP63072 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UbdP63072 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UbdP63072 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UbdP63072 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UbdP63072 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UbdP63072 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UbdP63072 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UbdP63072 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UbdP63072 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UbdP63072 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UbdP63072 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UbdP63072 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UbdP63072 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UbdP63072 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UbdP63072 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UbdP63072 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UbdP63072 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UbdP63072 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UbdP63072 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UbdP63072 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UbdP63072 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UbdP63072 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UbdP63072 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UbdP63072 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
UbdP63072 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UbdP63072 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UbdP63072 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UbdP63072 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UbdP63072 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UbdP63072 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
UbdP63072 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
UbdP63072 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UbdP63072 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UbdP63072 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UbdP63072 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UbdP63072 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UbdP63072 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UbdP63072 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UbdP63072 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UbdP63072 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UbdP63072 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UbdP63072 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UbdP63072 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
UbdP63072 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UbdP63072 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
UbdP63072 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UbdP63072 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UbdP63072 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UbdP63072 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UbdP63072 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UbdP63072 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UbdP63072 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
UbdP63072 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UbdP63072 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UbdP63072 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UbdP63072 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UbdP63072 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UbdP63072 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UbdP63072 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UbdP63072 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UbdP63072 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UbdP63072 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UbdP63072 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UbdP63072 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UbdP63072 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
UbdP63072 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UbdP63072 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UbdP63072 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UbdP63072 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UbdP63072 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UbdP63072 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UbdP63072 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
UbdP63072 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UbdP63072 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UbdP63072 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UbdP63072 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
UbdP63072 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UbdP63072 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UbdP63072 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UbdP63072 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UbdP63072 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
UbdP63072 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UbdP63072 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UbdP63072 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
UbdP63072 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UbdP63072 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UbdP63072 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UbdP63072 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UbdP63072 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UbdP63072 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UbdP63072 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UbdP63072 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UbdP63072 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UbdP63072 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UbdP63072 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UbdP63072 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UbdP63072 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UbdP63072 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UbdP63072 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UbdP63072 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms