Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gabra1P62812 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gabra1P62812 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms