Protein–RNA interactions for Protein: P62751

Rpl23a, 60S ribosomal protein L23a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23aP62751 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpl23aP62751 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms