Protein–RNA interactions for Protein: P62313

Lsm6, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm6P62313 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lsm6P62313 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm6P62313 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm6P62313 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm6P62313 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm6P62313 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm6P62313 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm6P62313 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm6P62313 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm6P62313 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm6P62313 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm6P62313 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm6P62313 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm6P62313 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm6P62313 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lsm6P62313 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm6P62313 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm6P62313 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm6P62313 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm6P62313 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm6P62313 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm6P62313 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm6P62313 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm6P62313 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm6P62313 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm6P62313 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm6P62313 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm6P62313 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm6P62313 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm6P62313 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm6P62313 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lsm6P62313 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsm6P62313 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lsm6P62313 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms