Protein–RNA interactions for Protein: P62301

Rps13, 40S ribosomal protein S13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps13P62301 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps13P62301 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps13P62301 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps13P62301 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rps13P62301 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps13P62301 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps13P62301 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps13P62301 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps13P62301 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps13P62301 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps13P62301 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps13P62301 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps13P62301 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps13P62301 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rps13P62301 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rps13P62301 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rps13P62301 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rps13P62301 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rps13P62301 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps13P62301 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps13P62301 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps13P62301 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps13P62301 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps13P62301 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps13P62301 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps13P62301 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps13P62301 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps13P62301 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps13P62301 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rps13P62301 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms