Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Smg6P61406 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smg6P61406 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Smg6P61406 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smg6P61406 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smg6P61406 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smg6P61406 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smg6P61406 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smg6P61406 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smg6P61406 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smg6P61406 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smg6P61406 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms