Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtnsP57757 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtnsP57757 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtnsP57757 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CtnsP57757 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CtnsP57757 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CtnsP57757 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CtnsP57757 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CtnsP57757 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CtnsP57757 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtnsP57757 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtnsP57757 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CtnsP57757 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms