Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NcstnP57716 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NcstnP57716 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NcstnP57716 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NcstnP57716 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NcstnP57716 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NcstnP57716 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NcstnP57716 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NcstnP57716 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NcstnP57716 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NcstnP57716 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NcstnP57716 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NcstnP57716 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NcstnP57716 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms