Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RabggtbP53612 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RabggtbP53612 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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