Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Map3k1P53349 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Map3k1P53349 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Map3k1P53349 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Map3k1P53349 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Map3k1P53349 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Map3k1P53349 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Map3k1P53349 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Map3k1P53349 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Map3k1P53349 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Map3k1P53349 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Map3k1P53349 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Map3k1P53349 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Map3k1P53349 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Map3k1P53349 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Map3k1P53349 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Map3k1P53349 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Map3k1P53349 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Map3k1P53349 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Map3k1P53349 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Map3k1P53349 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Map3k1P53349 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Map3k1P53349 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Map3k1P53349 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Map3k1P53349 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Map3k1P53349 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Map3k1P53349 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Map3k1P53349 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Map3k1P53349 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Map3k1P53349 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Map3k1P53349 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Map3k1P53349 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Map3k1P53349 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Map3k1P53349 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Map3k1P53349 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Map3k1P53349 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Map3k1P53349 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Map3k1P53349 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Map3k1P53349 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Map3k1P53349 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Map3k1P53349 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Map3k1P53349 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Map3k1P53349 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Map3k1P53349 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Map3k1P53349 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Map3k1P53349 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Map3k1P53349 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Map3k1P53349 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Map3k1P53349 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Map3k1P53349 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Map3k1P53349 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Map3k1P53349 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Map3k1P53349 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Map3k1P53349 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Map3k1P53349 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Map3k1P53349 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Map3k1P53349 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Map3k1P53349 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Map3k1P53349 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Map3k1P53349 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Map3k1P53349 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Map3k1P53349 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Map3k1P53349 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Map3k1P53349 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Map3k1P53349 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Map3k1P53349 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Map3k1P53349 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Map3k1P53349 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Map3k1P53349 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Map3k1P53349 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Map3k1P53349 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Map3k1P53349 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Map3k1P53349 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Map3k1P53349 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Map3k1P53349 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Map3k1P53349 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Map3k1P53349 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Map3k1P53349 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Map3k1P53349 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Map3k1P53349 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Map3k1P53349 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Map3k1P53349 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Map3k1P53349 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Map3k1P53349 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Map3k1P53349 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Map3k1P53349 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Map3k1P53349 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Map3k1P53349 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Map3k1P53349 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Map3k1P53349 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Map3k1P53349 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Map3k1P53349 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Map3k1P53349 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Map3k1P53349 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Map3k1P53349 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Map3k1P53349 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Map3k1P53349 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Map3k1P53349 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Map3k1P53349 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Map3k1P53349 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms