Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ube2e3P52483 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ube2e3P52483 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms