Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hcls1P49710 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Hcls1P49710 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Hcls1P49710 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcls1P49710 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcls1P49710 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcls1P49710 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcls1P49710 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcls1P49710 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcls1P49710 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcls1P49710 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcls1P49710 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcls1P49710 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcls1P49710 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcls1P49710 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcls1P49710 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcls1P49710 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcls1P49710 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcls1P49710 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcls1P49710 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcls1P49710 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcls1P49710 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hcls1P49710 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hcls1P49710 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hcls1P49710 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hcls1P49710 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hcls1P49710 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hcls1P49710 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hcls1P49710 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hcls1P49710 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hcls1P49710 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hcls1P49710 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hcls1P49710 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hcls1P49710 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hcls1P49710 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hcls1P49710 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hcls1P49710 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hcls1P49710 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hcls1P49710 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hcls1P49710 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hcls1P49710 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hcls1P49710 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hcls1P49710 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hcls1P49710 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hcls1P49710 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hcls1P49710 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hcls1P49710 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hcls1P49710 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms