Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nedd4P46935 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nedd4P46935 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms