Protein–RNA interactions for Protein: P41164

Etv1, ETS translocation variant 1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv1P41164 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Etv1P41164 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Etv1P41164 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Etv1P41164 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Etv1P41164 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Etv1P41164 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Etv1P41164 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Etv1P41164 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Etv1P41164 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Etv1P41164 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Etv1P41164 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Etv1P41164 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Etv1P41164 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Etv1P41164 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Etv1P41164 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Etv1P41164 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Etv1P41164 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Etv1P41164 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Etv1P41164 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Etv1P41164 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Etv1P41164 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Etv1P41164 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Etv1P41164 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Etv1P41164 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Etv1P41164 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Etv1P41164 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Etv1P41164 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Etv1P41164 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Etv1P41164 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms