Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PpargP37238 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PpargP37238 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PpargP37238 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PpargP37238 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PpargP37238 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PpargP37238 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PpargP37238 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PpargP37238 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PpargP37238 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PpargP37238 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PpargP37238 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PpargP37238 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PpargP37238 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PpargP37238 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PpargP37238 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PpargP37238 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PpargP37238 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PpargP37238 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PpargP37238 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PpargP37238 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PpargP37238 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PpargP37238 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PpargP37238 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PpargP37238 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PpargP37238 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PpargP37238 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PpargP37238 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PpargP37238 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PpargP37238 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PpargP37238 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PpargP37238 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PpargP37238 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PpargP37238 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PpargP37238 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PpargP37238 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PpargP37238 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PpargP37238 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PpargP37238 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PpargP37238 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PpargP37238 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PpargP37238 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PpargP37238 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PpargP37238 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PpargP37238 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PpargP37238 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PpargP37238 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PpargP37238 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PpargP37238 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PpargP37238 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PpargP37238 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PpargP37238 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PpargP37238 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PpargP37238 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PpargP37238 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PpargP37238 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PpargP37238 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PpargP37238 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PpargP37238 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PpargP37238 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PpargP37238 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PpargP37238 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PpargP37238 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PpargP37238 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PpargP37238 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PpargP37238 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PpargP37238 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PpargP37238 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PpargP37238 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PpargP37238 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PpargP37238 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PpargP37238 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PpargP37238 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PpargP37238 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PpargP37238 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PpargP37238 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PpargP37238 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PpargP37238 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PpargP37238 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PpargP37238 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PpargP37238 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PpargP37238 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PpargP37238 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PpargP37238 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PpargP37238 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PpargP37238 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PpargP37238 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PpargP37238 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PpargP37238 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PpargP37238 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PpargP37238 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PpargP37238 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PpargP37238 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PpargP37238 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PpargP37238 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PpargP37238 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PpargP37238 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PpargP37238 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PpargP37238 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PpargP37238 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97 ms