Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sftpa1P35242 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sftpa1P35242 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sftpa1P35242 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sftpa1P35242 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sftpa1P35242 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sftpa1P35242 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sftpa1P35242 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sftpa1P35242 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sftpa1P35242 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sftpa1P35242 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sftpa1P35242 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sftpa1P35242 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sftpa1P35242 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sftpa1P35242 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sftpa1P35242 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sftpa1P35242 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sftpa1P35242 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sftpa1P35242 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sftpa1P35242 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms