Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nedd1P33215 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms