Protein–RNA interactions for Protein: P31315

Gsx1, GS homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx1P31315 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gsx1P31315 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gsx1P31315 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gsx1P31315 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gsx1P31315 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gsx1P31315 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gsx1P31315 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gsx1P31315 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gsx1P31315 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gsx1P31315 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gsx1P31315 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gsx1P31315 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gsx1P31315 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gsx1P31315 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gsx1P31315 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gsx1P31315 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gsx1P31315 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gsx1P31315 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gsx1P31315 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gsx1P31315 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gsx1P31315 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gsx1P31315 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gsx1P31315 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gsx1P31315 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gsx1P31315 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gsx1P31315 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gsx1P31315 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gsx1P31315 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gsx1P31315 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gsx1P31315 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gsx1P31315 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gsx1P31315 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gsx1P31315 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gsx1P31315 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gsx1P31315 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gsx1P31315 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gsx1P31315 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gsx1P31315 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gsx1P31315 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gsx1P31315 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gsx1P31315 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gsx1P31315 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gsx1P31315 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gsx1P31315 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gsx1P31315 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gsx1P31315 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gsx1P31315 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gsx1P31315 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gsx1P31315 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gsx1P31315 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gsx1P31315 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gsx1P31315 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gsx1P31315 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gsx1P31315 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Gsx1P31315 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gsx1P31315 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gsx1P31315 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gsx1P31315 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gsx1P31315 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gsx1P31315 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gsx1P31315 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gsx1P31315 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gsx1P31315 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gsx1P31315 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gsx1P31315 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gsx1P31315 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gsx1P31315 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gsx1P31315 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gsx1P31315 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gsx1P31315 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gsx1P31315 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gsx1P31315 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gsx1P31315 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gsx1P31315 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gsx1P31315 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gsx1P31315 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gsx1P31315 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gsx1P31315 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gsx1P31315 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gsx1P31315 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gsx1P31315 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gsx1P31315 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gsx1P31315 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gsx1P31315 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gsx1P31315 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gsx1P31315 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gsx1P31315 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gsx1P31315 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gsx1P31315 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gsx1P31315 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gsx1P31315 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gsx1P31315 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gsx1P31315 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gsx1P31315 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gsx1P31315 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gsx1P31315 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gsx1P31315 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gsx1P31315 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gsx1P31315 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gsx1P31315 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms