Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Ctnnd1P30999 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ctnnd1P30999 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ctnnd1P30999 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ctnnd1P30999 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ctnnd1P30999 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ctnnd1P30999 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ctnnd1P30999 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ctnnd1P30999 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ctnnd1P30999 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ctnnd1P30999 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ctnnd1P30999 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ctnnd1P30999 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctnnd1P30999 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctnnd1P30999 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctnnd1P30999 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctnnd1P30999 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctnnd1P30999 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctnnd1P30999 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctnnd1P30999 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctnnd1P30999 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctnnd1P30999 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctnnd1P30999 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctnnd1P30999 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctnnd1P30999 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctnnd1P30999 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctnnd1P30999 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctnnd1P30999 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ctnnd1P30999 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ctnnd1P30999 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ctnnd1P30999 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ctnnd1P30999 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ctnnd1P30999 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms