Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-DMaP28078 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-DMaP28078 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms