Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
PdgfraP26618 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PdgfraP26618 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms