Protein–RNA interactions for Protein: P21275

Bmp4, Bone morphogenetic protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp4P21275 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bmp4P21275 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bmp4P21275 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bmp4P21275 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bmp4P21275 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bmp4P21275 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bmp4P21275 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bmp4P21275 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bmp4P21275 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bmp4P21275 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bmp4P21275 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bmp4P21275 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bmp4P21275 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bmp4P21275 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bmp4P21275 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bmp4P21275 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bmp4P21275 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bmp4P21275 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bmp4P21275 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bmp4P21275 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Bmp4P21275 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bmp4P21275 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Bmp4P21275 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bmp4P21275 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bmp4P21275 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bmp4P21275 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bmp4P21275 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bmp4P21275 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bmp4P21275 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bmp4P21275 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Bmp4P21275 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Bmp4P21275 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Bmp4P21275 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Bmp4P21275 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Bmp4P21275 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Bmp4P21275 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Bmp4P21275 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Bmp4P21275 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms