Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TP20293 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TP20293 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TP20293 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TP20293 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TP20293 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TP20293 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TP20293 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TP20293 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TP20293 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TP20293 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TP20293 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TP20293 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TP20293 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TP20293 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TP20293 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TP20293 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TP20293 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TP20293 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TP20293 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TP20293 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TP20293 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TP20293 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TP20293 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TP20293 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TP20293 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TP20293 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TP20293 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TP20293 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TP20293 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TP20293 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TP20293 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TP20293 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TP20293 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TP20293 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TP20293 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TP20293 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TP20293 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TP20293 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TP20293 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TP20293 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TP20293 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TP20293 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TP20293 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TP20293 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TP20293 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TP20293 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TP20293 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TP20293 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TP20293 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TP20293 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TP20293 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TP20293 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TP20293 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TP20293 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TP20293 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TP20293 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TP20293 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TP20293 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TP20293 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TP20293 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TP20293 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TP20293 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TP20293 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TP20293 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TP20293 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TP20293 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TP20293 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TP20293 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TP20293 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TP20293 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TP20293 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TP20293 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TP20293 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TP20293 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TP20293 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TP20293 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TP20293 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TP20293 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TP20293 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TP20293 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TP20293 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TP20293 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TP20293 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TP20293 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TP20293 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TP20293 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TP20293 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TP20293 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TP20293 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TP20293 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TP20293 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TP20293 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TP20293 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TP20293 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TP20293 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TP20293 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TP20293 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TP20293 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TP20293 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms