Protein–RNA interactions for Protein: P16390

Kcna3, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna3P16390 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcna3P16390 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcna3P16390 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcna3P16390 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcna3P16390 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcna3P16390 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcna3P16390 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcna3P16390 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcna3P16390 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcna3P16390 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcna3P16390 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcna3P16390 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcna3P16390 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcna3P16390 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcna3P16390 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcna3P16390 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcna3P16390 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcna3P16390 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcna3P16390 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcna3P16390 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcna3P16390 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcna3P16390 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcna3P16390 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcna3P16390 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcna3P16390 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcna3P16390 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcna3P16390 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcna3P16390 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcna3P16390 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcna3P16390 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcna3P16390 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcna3P16390 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcna3P16390 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcna3P16390 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcna3P16390 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcna3P16390 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcna3P16390 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcna3P16390 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcna3P16390 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcna3P16390 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcna3P16390 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcna3P16390 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcna3P16390 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcna3P16390 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcna3P16390 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcna3P16390 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcna3P16390 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcna3P16390 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcna3P16390 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcna3P16390 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcna3P16390 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcna3P16390 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcna3P16390 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcna3P16390 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcna3P16390 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcna3P16390 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcna3P16390 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcna3P16390 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcna3P16390 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcna3P16390 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcna3P16390 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcna3P16390 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcna3P16390 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcna3P16390 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcna3P16390 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcna3P16390 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcna3P16390 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcna3P16390 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcna3P16390 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcna3P16390 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcna3P16390 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcna3P16390 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcna3P16390 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcna3P16390 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcna3P16390 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcna3P16390 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcna3P16390 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcna3P16390 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcna3P16390 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcna3P16390 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcna3P16390 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcna3P16390 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcna3P16390 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcna3P16390 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kcna3P16390 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcna3P16390 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcna3P16390 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcna3P16390 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcna3P16390 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcna3P16390 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcna3P16390 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcna3P16390 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcna3P16390 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcna3P16390 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcna3P16390 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcna3P16390 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcna3P16390 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcna3P16390 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcna3P16390 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcna3P16390 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms