Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chrm1P12657 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chrm1P12657 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chrm1P12657 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chrm1P12657 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chrm1P12657 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chrm1P12657 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Chrm1P12657 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chrm1P12657 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chrm1P12657 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chrm1P12657 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chrm1P12657 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chrm1P12657 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Chrm1P12657 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chrm1P12657 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chrm1P12657 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chrm1P12657 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chrm1P12657 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Chrm1P12657 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chrm1P12657 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chrm1P12657 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Chrm1P12657 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chrm1P12657 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chrm1P12657 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chrm1P12657 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chrm1P12657 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chrm1P12657 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Chrm1P12657 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Chrm1P12657 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Chrm1P12657 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Chrm1P12657 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Chrm1P12657 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Chrm1P12657 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms